Гатунское озеро площадью в 424 км2 дает возможность питания водой шлюзов и получения судоходного фарватера на протяжении 35 км без всякой специальной выемки земли; вместе с тем оно устранило серьезные затруднения, причиняемые ежегодными разливами р. Чагрес.

Гатунская плотина состоит из каменной отсыпи и земляного намывного тела сооруженного с помощью рефулера и пересекает оба рукава р. Чагрес. Бетонный водослив построен на возвышенности между ними. Западный конец плотины упирается в крутой берег долины, а восточный примыкает к шлюзам. Длина гребня плотины около 2,5   км, а ширина ее основания в русле р. Чагресс доходит до 0,8 км. Гребень плотины, расположенный на высоте + 32 м, возвышается на 6,1   м над нормальным уровнем воды в Гатунском озере. Ширина гребня плотины — 30,5 м ширина плотины на уровне воды — 122 м. Часть откоса плотины, подверженная прибою волн, вымощена.

Озеро Мирафлорес образовалось в результате подпора Рио- Грандо и ее незначительных притоков плотиной Мирафлорес. Озеро это образует промежуточный бьеф между Тихим океаном и Гатунским озером. Его поверхность на отметке + 16,75 м — на 9,15 м ниже нормального уровня Гатунского озера.

Плотина при Педро-Мигуэле направлена от западной стены шлюза почти параллельно каналу до близлежащих холмов, в которые и упирается. Плотина имеет гребень на отметке -32 м и состоит из каменных набросных призм и земли, утрамбованной слоями. Плотина при Мирафлорес состоит подобно Гатунской из намывного земляного заполнения между каменными отсыпками и имеет примыкающий к шлюзам водослив с гребнем по прямой линии с восемью пролетами по 13,71 м. Гребень водослива находится на отметке +11,19 я.

Шлюзы на Панамском канале — бетонные. На спуске к Атлантическому океану построен один трехкамерный Гатунский шлюз с двумя параллельными линиями судоходных камер.