Через Москву протекают следующие реки: Москва, Яуза и несколько более мелких. Река Москва берет свое начало из болота, называемого Москворецкою лужею, находящегося в Гжатском уезде Смоленской губернии и протекает через уезды: Можайский, Рузский, Звенигородский и Московский и затем втекает в Москву в Пресненской части, с западной стороны. На границе Рязанской и Московской губерний впадает в реку Оку, выходя из Москвы с юго-восточной стороны, между Серпуховской и Рогожской частями, и протекая Бронницкий и Коломенский уезды. Протяжение реки Москвы от истоков до устья — 420 верст, из которых 400 приходится на Московскую губернию; ширина от 7—60 сажен; глубина от 1/2 аршина до 6 сажен. Замерзая около 1 ноября и вскрываясь около 1 апреля, Москва-река открыта для судоходства в продолжение года средним числом до 200 дней.

Река Яуза, на протяжении которой расположены большею частью фабрики и заводы, впадает в Москву-реку близ Воспитательного дома. Прежде кругом Кремля протекала речка Неглинная, но теперь она засыпана, и то пространство, на котором она находилась, занимает Александровский сад. Москвичи до сих пор зовут проезд вокруг сада «на Неглинной». Прудов в Москве до 200. Более известные из них: Патриарший, Чистые пруды, Самотека и знаменитый Лизин пруд, памятный по повести Карамзина «Бедная Лиза», пользовавшейся в свое время громадным успехом. На Москве-реке пять мостов: Москворецкий, Ново-Москворецкий (прежний Каменный), Бородинский, Крымский и Краснохолмский. На реке Яузе тоже есть несколько мостов, также и на канаве, которая начинается немного выше Ново-Москворецкого моста и снова соединяется с рекой Москвой ниже Краснохолмского моста.

Москва снабжается водою, кроме реки, из фонтанов, устроенных в разных частях города и имеющих своим бассейном Сухареву башню, куда вода проведена подземными трубами из 45 ключей чистой воды, находящихся в 17 верстах от Москвы по Троицкой дороге, открытых в царствование Екатерины II. Кроме этого, в Москве есть несколько колодцев.

Москва разделяется двояко: в историческом плане на Кремль, Китай-город, Белый город, Земляной город и предместья (окрестности); в административном плане она делится на 17 частей и 3 полицейских отделения.